بازگذاشتن دست سلفیون تکفیری در آزار پیروان مذاهب دیگر را نیز باید از دست آوردهای دولت مرسی به شمار آورد چرا که این دولت هیچگاه به اعتراضها در این خصوص ترتیب اثر نداد و در مواردی صرفاً به محکومیتهای لفظی دراینباره اکتفا کرد امری که دست یافتن به عدالت پایدار و حاکمیت قانون زیر سایه حکومت اخوان المسلمین را در این کشور با تردید جدی مواجه کرد.